freeeのデメリット・弱点まとめ｜中小企業が導入前に知っておくべきこと

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「freeeを導入しようか迷っている」「freeeの悪い口コミが気になる」という方へ。結論から言うと、freeeはクラウド会計の先駆けとして機能は充実していますが、中小企業によっては合わないケースも存在します。

この記事では、freeeのデメリット・弱点を正直にまとめ、向いていない会社のタイプとその対策を解説します。

※料金・機能は2026年5月時点の情報です。最新情報はfreeeの公式サイトでご確認ください。

freeeのデメリット5選（正直に解説）

デメリット1：簿記知識がないと設定が難しい場面がある

freeeは「簿記不要」を謳っていますが、初期設定（勘定科目の割り当て・取引ルールの設定）は実際にはある程度の会計知識が助けになります。特に「自動仕訳の結果を確認・修正する」作業は、仕組みを理解していないと放置しがちになり、決算期に大量の未処理が発生するリスクがあります。

対策：導入時に税理士・会計士に設定を依頼するか、freeeが提供する無料のウェビナー・サポートを活用する。

デメリット2：月額料金がやや高め（プランによっては割高感）

freeeの法人向けプランは、年払いの月額換算で2,980円〜39,780円（税抜）です。2024年7月の法人プラン再編以降、経費精算などの機能は従量課金（1人あたり月300円・年払い時）が別途かかります。

弥生会計 Next のエントリープラン（年34,800円・税抜／月換算2,900円）と比較すると、長期利用でのコストが高くなる場面があります。特に「今すぐ高度な機能は不要」な小規模事業者にとってはコストが見合わないケースも。

デメリット3：動作が重い・ブラウザによっては不安定

複数のタブを開いた状態や古いPCでは、画面遷移・データ読み込みに時間がかかるという口コミが見られます。特に月次締め処理など大量のデータを扱う時期にストレスを感じるユーザーも一定数います。

対策：推奨ブラウザ（Google Chrome）を使用し、タブを整理してから操作する。

デメリット4：カスタマイズ性に限界がある

freeeはクラウドSaaSのため、画面レイアウトや帳票の細かいカスタマイズが難しい場面があります。独自の取引形態・特殊な仕訳パターンが多い業種（建設業・不動産業など）では、標準機能だけでは対応しきれず、別途Excelでの管理が必要になることがあります。

デメリット5：サポートに時間がかかることがある

スタータープランはチャット・メールサポートが中心で、電話サポートは上位プランでないと使えない（2026年5月時点）。決算直前など繁忙期にすぐサポートを受けたい場合、プランのアップグレードが必要になることがあります。

freeeが向いていない会社・ケース

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デメリットをカバーする方法

他社と比べたときの費用感を確認したい場合は会計ソフトの費用相場｜中小企業の月額料金と3社の実額比較が参考になります。

1. 税理士と連携して初期設定を任せる

freeeは税理士との共有機能が充実しています。初期設定だけでも税理士に依頼することで、仕訳ミスのリスクを大幅に下げられます。

2. スタータープランで3ヶ月試してから判断する

実際に乗り換えを決めた場合の移行先の選び方と手順は、freeeから乗り換えるなら？値上げ後のおすすめ会計ソフトと移行手順【2026年】でまとめています。CSVを使った具体的な移行ステップも解説しているので参考にしてください。

いきなりプレミアムプランを契約せず、最低プランで試用期間を設けて自社に合うか確認するのが低リスクです。合わないと感じれば弥生やマネーフォワードへの乗り換えも選択肢に入ります。

3. freeeのサポートリソースを積極活用する

公式のヘルプセンター・動画マニュアル・コミュニティフォーラムは充実しています。特に導入直後は積極的に活用し、疑問をためないようにすることが継続利用のカギです。

それでもfreeeを選ぶべき理由

デメリットを踏まえた上で、freeeが特に強い場面もあります。

freeeは会計・給与・人事労務・請求書発行を一体管理できるエコシステムが強みです。「バラバラのツールを統合したい」というニーズには、競合より一歩リードしています。

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まとめ

freeeのデメリットは「初期設定のハードル」「コスト」「特殊業種への対応力」の3点に集約されます。これらが自社に当てはまるかを無料トライアルで確認してから、導入判断をするのが現実的です。

freeeとマネーフォワードの詳細比較は別記事でまとめています。

→ 周辺サービスの費用は「freeeの経費精算は割高？」と「freee人事労務の評判とデメリット」でそれぞれ人数別に計算しています。